中外合资专业与普通专业的区别主要在于学费、学历、办学形式、录取分数线的不同。中外合资专业有外教授课的课程，所以学费比普通专业高。但在招生过程中，中外合资专业的录取分数线普遍低于普通本科专业。中外合资专业的学生在校期间在国内学习，但毕业后获得的学历证书是国外大学的毕业证；普通专业获得国内文凭。中外合资专业的办学形式采用国外先进的教育模式，普通高考采用国内统一的教学形式。两种办学形式不同。
山西一课教育平台提到中外合作专业，绝大部分考生和家长方面都有自己下意识觉得从心理上矮人一等，觉得这属于花钱买分数，有点偷偷摸摸的感觉，老怕这里可以被人歧视那里被人瞧不起，那怎么正确看待这些问题呢？
总有很多家长和学生觉得学校不重视中外合作办学，画一个圈，让最差的老师教，很多设施都不能享受，这种自卑心理。现在的大学都是自由选择课程的，主修课程是主体，不清楚谁是谁，也规定中外合作办学不能选择什么课程，不能去哪里上课，从来没听说过这样的。当然，校园形式的中外合作学校不能享受总部的资源，但学校可以提供足够的资源，也可以安排到总部学习，比如北京邮电大学宏福学院。
在学制方面，有2+2(国内2年，国外2年)、3+1(国内3年，国外1年)、4+0(国内4年，不出国)、4+1(国内4年，国外1年取得硕士学位)等，这与国内大学普通专业4-5年的学制相比，更具弹性。
此外，有一个外国的生活经历有利于丰富孩子的经验，增加他们的知识，接受不同的文化，培养他们的独立思考能力。
山西一课教育平台认为中外合作办学的一大特点就是对语言学习能力的重视与高要求，很多国家课程都会采取全英文授课的形式，要求我们学生需要具备较强的听力水平和口语表达自己能力，对于培养学生数学语言教学能力的提升工作还是很有帮助的。
中外合作大学，没有研究生的机会保证；如果你想考国内的研究生，你需要自学政治。中外合作办学可以从合作大学取得研究生学位，国内大学不能。
中外专业毕业后将颁发两种证书，一种是公立学校文凭和学位证书，另一种是外国大学颁发的学位证书。受过双重教育的毕业生在国内外都有较好的就业前景。